Стоит ли разделять рекламу для декстопа и мобильных?

Однозначно стоит.

Здесь работает принцип шагов. Сначала разберитесь с настройкой рекламных блоков для декстопа: определение мест блоков на вашем сайте, количества желаемых блоков, дизайна и других оптимизационных моментов. Затем приступайте к настройкам мобильной версии. Ваше цель - максимально адаптивные блоки, не отвлекающие пользователя рекламой.

Одновременная работа с декстопными и мобильными блоками повышает доход на 10-15%.